12月15日，指原莉乃在HKT48演唱会上宣布了毕业，并说到：“这么突然的宣布真的非常抱歉。这是几年前就决定了的事情，毕业的日程也已经决定了。”她将在4月28日在横滨举行毕业演唱会，5月28日在福冈举行大感谢祭。

　　2017年6月17日，在第9回AKB48选拔总选举中，指原莉乃以高约10万票的优势夺冠，也是AKB首个三连霸。